Formation continue courte
EcoSystèmes : modélisation et quantification
Modélisation d’écosystèmes et méthodes statistiques : traitement des données d’écosystèmes.
Mise à jour : 16/03/2026
Modéliser, c’est apprendre à simplifier le réel pour mieux le comprendre. En écologie, cela permet d’explorer la dynamique des écosystèmes, d’anticiper leur évolution et d’appuyer les décisions. À travers une initiation à la pensée du modélisateur, des réflexions épistémologiques et une application concrète à un cas montpelliérain, cette approche est mise en pratique. En parallèle, des outils statistiques sont mobilisés pour analyser des données complexes : régressions, modèles mixtes, gestion des dépendances spatiales ou temporelles et introduction aux modèles linéaires généralisés (GLM en anglais) . Une combinaison essentielle pour saisir la complexité du vivant à partir des données.
- Dates
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- Dates à définir
- Vous êtes
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- étudiant·e titulaire d'un diplôme français
- étudiant·e international·e
- salarié·e ou demandeur·se d'emploi
- ingénieurs agronomes/écologues, chercheurs, doctorants désirant monter en compétences : data analyst, data scientist, statisticien, ingénieur en machine learning, ingénieur en modélisation, bio-informaticien, consultant en data.
- Lieu
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- L'Institut Agro Montpellier (Campus la Gaillarde)
Objectifs
Modélisation
- Améliorer la compréhension d’un système en confirmant/infirmant des hypothèses par comparaison avec des données réelles.
- Prédire le comportement d’un système : modèles déterministes, probabilistes et possibilistes.
- Réaliser des expériences de pensée et analytiques sur des cas d'étude réalistes.
Quantification (Statistique)
- Expliquer certains caractères observés par d'autres.
- Prédire les valeurs d'un caractère à l'aide de celles d'autres caractères.
Thèmes
- Informatique, bio-statistique, data sciences
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Contenu et programme
Langues d'enseignement : français
Contenu et programme Modélisation (8 h)
- Introduction à la modélisation : Comment penser comme un modélisateur ?
- Justification philosophique (épistémologie) de la modélisation.
- Panorama des modèles utilisés en écologie, avec un accent sur les modèles qualitatifs et à évènements discrets.
- Courte application à un cas d'étude montpellierain : l'îlot des singes hurleurs du parc du Lunaret, conception d'un modèle jouet pour prévoir l'état de santé de l'îlot.
Quantification (statistique, 22h)
- Rappels sur le modèle linéaire (régression linéaire, anova, analyse de la covariance).
- Puissance statistique.
- Prise en compte des effets aléatoires: modèles mixtes.
- Gestion de données ne satisfaisant pas les hypothèses classiques d'un modèle linéaire: notamment hétéroscédasticité, intro sur la gestion de la dépendance temporelle ou spatiale.
- Generalized Linear Models (GLM).
Mots clés : OffreEcosystemes, statistique, modèle linéaire, gestion des données, General Linear Models
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Conditions d'admission
Pré-requis :
- Avoir des bases en statistique (niveau M2), savoir utiliser R et R studio, avoir visionné les différentes vidéos.
- Utiliser des modèles linéaires et avoir le souhait d’approfondir.
- Disposer d’un ordinateur avec les logiciels R, R studio et R Markdown.
Ce module s’adresse à un niveau Master 2, avec un niveau avancé en statistique. Il n’est pas adapté aux débutants, mais plutôt aux personnes ayant déjà une pratique des statistiques basiques et souhaitant approfondir leurs compétences.
La fiche de candidature est à compléter et à envoyer à meili.baragatti@supagro.fr
Responsables pédagogiques
-
Meili BARAGATTI
Enseignant-chercheur
- Département Sciences pour les agrobioprocédés (SABP)
- UMR Mathématiques, Informatique et STatistique pour l'Environnement et l'Agronomie (MISTEA)
- L'Institut Agro Montpellier (Campus la Gaillarde)
Email : meili.baragatti@supagro.fr
Téléphone : +33 (0)4 99 61 25 40
Téléphone : +33 (0)4 99 61 25 40
Partenaires
- Université de Montpellier
Lieu
L'Institut Agro Montpellier
Campus de La Gaillarde
2 place Pierre Viala
34060 Montpellier - France
Inscription
Tarifs
2.100 €
Les repas, les hébergements et les déplacements ne sont pas pris en charge par L’Institut Agro Montpellier.
Tarif indiqué hors taxes, notre organisme étant assujetti à la TVA mais bénéficie d'une exonération pour la formation professionnelle continue conformément aux dispositions de l'article 261 du CGI.
- Salarié·es avec financement employeur ou OPCO, exploitant·es agricoles avec prise en charge VIVEA, agent·es Cirad ou INRAE : tarif préférentiel (nous consulter)
- Formation non éligible au CPF (Compte Personnel de Formation)
A noter
- Les cours de modélisation (8h) ont lieu sur le campus de la Fac des Sciences (Triolet). Les cours de statistique (22h) ont lieu sur le campus de la Gaillarde.
- Pas de financement CPF
Modalités pédagogiques
- La partie théorique sera étudiée à l’aide d’un polycopié détaillé et des vidéos
- Le présentiel sera consacré aux questions sur la partie théorique, à des exercices applications directes du cours et à des exercices plus complexes
- Applications pratiques sur ordinateur : utilisation d’une plateforme de modélisation, de R, Rstudio et Rmarkdown
Contacts
-
Meili BARAGATTI
Enseignant-chercheur
- Département Sciences pour les agrobioprocédés (SABP)
- UMR Mathématiques, Informatique et STatistique pour l'Environnement et l'Agronomie (MISTEA)
- L'Institut Agro Montpellier (Campus la Gaillarde)
Email : meili.baragatti@supagro.fr
Téléphone : +33 (0)4 99 61 25 40
Téléphone : +33 (0)4 99 61 25 40
L'Institut Agro Montpellier
2 place Pierre Viala
34060 Montpellier - France
Tél. : +33 (0)4 99 61 22 00 Tél. : +33 (0)4 99 61 22 00
Fax : +33 (0)4 99 61 29 00
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